紅豆杉雌雄異株、異花授粉、植株間隔，導致授精受阻、種子數量減少。種子當年成熟，假種皮厚，自然條件下需兩冬一夏才能萌芽。雖然偶有天然更新苗，但大多數種子休眠期內己腐爛或干燥失水失去活力。
紅豆杉幼苗長勢慢、抗逆性差、成活率低，決定了野生紅豆杉資源分散性、有限性及發展難度，這也是紅豆杉稀有瀕危的客觀原因所在。
紅豆杉生長較慢，據測定，樹齡100年以上的紅豆，胸徑40厘米左右。人工栽培能顯著提高生長速度，廣西臨桂海拔560米的低山造林，造林成活率100%，3年平均高91.6厘米、平均地徑1.45厘米，年平均高長量約為高30.5厘米。
